<?
$sorgu2=mysql_query("select * from kategori where alt='' order by baslik asc");
while($web2 = mysql_fetch_array($sorgu2)){
?>
<option value="<?=$siteadresi;?>/<?=$web2['seo'];?>_<?=$web2['grupseo'];?>.html" onclick="kategorigit(this.value);"><?=$web2['baslik'];?> <?=$web2['grup'];?></option>
<?
$query2ft = "SELECT * FROM kategori where alt='$web2[id]' order by baslik asc";
$result2ft = mysql_query ($query2ft) or die ("hata");
while ($line2ft = mysql_fetch_array($result2ft)) {?>

<?}}?>

Anladığım kadarıyla istediğiniz bu. İlk ve son satırlara select tagının açılış ve kapanış taglarını koyun.