Sitene virüs bulaşmasını ftp o kadar etkilemez herkes mesela filezilla önermiş bende öneririm ama onu kullandığımda da virüs 2 kere bulaşmıştı zamanında, yani ftp programından daha önemlisi bilgisayarında aktif olan anti-virüs ve anti-spy'dır.. Onlar kaliteli programlar olduğu sürece ftp nde güvende olur.