Lighttpd kullanacaksan cpanel kullanmana gerek yok bence heleki 1 site barındırıyorsan hiç gerek yok. lxadmin kontrol paneli lighttpd destekliyor ona bi göz at derim. onun dışında lighttpd apacheye göre daha az bellek kullanıyor bu da senin için avantaj. 2gb ramli bir sunucuda lighttpd ile 3k tekil anlık 50 kişinin çok rahat üstesinden gelirsin. my.cnf muhabbetini bir şekilde halledersin zaten tuning script gerekli yönlendirmeleri yapıyor.