Apache 2 ve sonrasında mod_rewrite otomatik olarak gelir. Herhangi bir işleme gerek yoktur. Büyük ihtimalle scriptinizde mod_rewrite ın açık olup olmadığını gösteren bir yer vardır burdan siz bakıyorsunuzdur. Php handle DSO ya getirip yeniden scriptinize bakın. İlginçtir fakat bu şekilde düzeliyor.Fakat dediğim gibi yanlış anlaşılma olmasın handle ile ilgili değil mod rewrite.Bunu kanıtlamak için herhangi bir scripte seo kurabilirsiniz.