Merhaba,

WordPress ve WordPress Multi Site yedeklerini almakta teorik olarak çok fark yok.
Sıkıntı şuradan kaynaklanıyor ki, ikincisinde daha çok tablo var ve işin ucu biraz kaçabilir.

Bu konuda çözüm olarak tabloların tek tek yedeklerini almaktansa veritabanının yedeğini almak gerekiyor. (Zaten öyle yapıyoruz demeyin, eklentiler hangi tabloları yedeklerse onları yedekliyorsunuz. Sorun da bunu yapan bir eklenti olmaması.)

Düzenli yedekler için shell scriptleri kullanabilirsiniz, sanırım en uygun çözüm bu olacaktır.

Bu adresteki script yeterli gibi http://bash.cyberciti.biz/backup/bac...base-server-2/ dahasını da arayıp bulmak mümkün.