kodlar o sunucuda belli yerlerden belli şeyler çekiyor, çalıştırıyor, sorguluyordur. Bu "şeyler" senin sunucunda olmayacağı için js o zaman çalışmayacaktır. bunun nasıl işlediğini görmek için al bir tane hazır php scripti (js kullanan) o içindeki js yi al başka bir dosyanın içine koy. Sonuç aynı, çalışmayacaktır.