Bunun nedeni google un,

siteadresi.com

ile

www.siteadresi.com

adreslerinin farklı iki adres olarak görmesinden kaynaklanıyor. sitenin her iki halinede doğrulama kodunu koyman lazım. Ancak bu senin büyük bir hata yaptığını gösteriyor. Sana ait sitenin iki ayrı adres gibi görülmemesi için, siteni hangi adresten yayınlamak istiyorsan diğerine 301 yönlendirmesi yapman lazım. Yapmayınca google senin iki ayrı adresin var zanneder. Bu da kendi kendini dublicate content (kopya içerik kullanımı) durumuna düşürmene neden olur.

iki siteninde ikisine aynı şekilde doğrulama kodu ile doğruladım derken sitenin.com ve www.sitenin.com adreslerini kastettiğini varsayıyorum. Bu hatayı verdiğine göre o doğrulamardan birini kabul etmemiş olmalı.

Gelelim esas sorunun kolay çözümüne;

Yapmak istediğin iş için, nukedestek.com adresine diğer domain için redirect komutu uygula. Bu sayede diğer sitenin her türlü link gücü kısa bir sürede diğerine aktarılır. Ayrıca istediğin yönlendirme sorunsuzca tamamlanmış olur.