Alıntı
[mysqld]
set-variable = max_connections=200
safe-show-database
local-infile=0
table_cache = 512
skip-locking
read_buffer_size = 1M
log_slow_queries=/var/log/mysqld.slow.log
long_query_time=5
log_queries_not_using_indexes
tmp_table_size = 32M
skip-name-resolve
thread_cache_size = 128
query_cache_limit = 1M
query_cache_size = 1M
concurrent_insert=2
my.cnf içine bunları ekleyip denermisiniz.

kırmızı yazdığım kısmın çalışması için ssh ile bağlanıp aşağıdaki komutları vermeli veya kullandığınız panel ile mysqld.slow.log dosyasını oluşturmalısınız.

ssh için komutlar (satırı ayrı yazıp enterlayın)

Alıntı
touch /var/log/mysqld.slow.log
chmod 777 /var/log/mysqld.slow.log
bittiğinde mysql restart etmeyi unutmayın.