bu saatte çok php kodu düşünemiyorum ama aklıma ilk gelen şu,

1-49 arasınbı full sql de bir yere işlerim. sonra gün gün çıkan sayılar teker teker sqlde update yapılır ve bulduğu yere cikmasayisi = cikmasayisi+1 yapar geçer. tüm yılı bitirdikten sonra sqld en çekerken order by cikmasayisi desc yaparsın. böylece hangi sayı kaç defa çıkmış rahatlıkla bulursun