Bu sorun sadece bir cgi-perl açığından ibaret değil. Bunu engelleseniz shell scriptler ile aşabilirler bunu dan engelleseniz başka türlü aşarlar, zaten SSH erişimi verdiğiniz herkes bu şekilde site hackler. Kullanıcı yetkileri bazında düzenleme yapılması gerekli sunucu çapında.