Evet, dpi her türlü düşüyor ayrıca crop ile resize aynı şey değildir biri mevcut resmi belli oranlarda tekrar boyutlandırır. Diğeri ise mevcut resimden bir parça keser.

http://tr.php.net/manual/tr/function...resolution.php

Imagick sınıfını inceleyiniz. Verdiğim linkte dpi ayarı yapılıyor gördüğüm kadarıyla