iframe ile virüs yayılması iframe kodunun zararlı olduğu anlamına gelmez. iframe kodları arasında yasak sitelerden (virüs dağıtan ve içerik olarak yasaklanan) birisi varsa google da siteniz rezil oluyor tamam ama iframe kodunu siz kullanıyorsanız böyle birşey olmaz.

Joomla sistemini ele alalım; iframe kodunu mantık olarak alan bir modülü var, siteyi ekliyorsunuz ve sitenin görüntüsü aynen sizin sitenizdeki istediğiniz bir bölüme yansıyor. joomla gibi kalite bir sistem bile bunu kullanıyorsa mantığını siz kurun. Ha iframe koduna denk gelen başka birşey yaptıysanız ve bu gözünüzden kaçıyorsa ayrı bir olay.