elbette sorun olur, sen nameserverlerini baska yere yonlendiriyorsun ve DNS bolgesinde farklı ns tanımlıyorsun.
öncelikle sana verilen IP adreslerine ns1.domain.com ns2.domain.com olarak nameserver olusturacaksın sonrasında DNS (zone) bolgesinden ns1 ve ns2 ye A kaydı yaparak IP adreslerini gireceksin
DNS bolgendeki nameserver adreslerin ise ns1.domain.com ve ns2.domain.com olacak
sonrasında problemin duzelecektir.
ek olarak
http://intodns.com/domain.com yazarak DNS (zone) bolgesinin sorunsuz calısıp calısmadıgını kontrol edebilirsin