http://www.ioncube.com/loader_download.php adresinden bulunduğunuz sunucu için uygun dosyayı indirin.
Örnek olarak Linux (x86) yı indirirseniz

wget http://downloads2.ioncube.com/loader...lin_x86.tar.gz
ardından dosyayı tar.gz den çıkartın

tar -zxvf ioncube_loaders_lin_x86.tar.gz

mv ioncube /usr/local ile taşıyınız

nano /usr/local/lib/php.ini php.ini dosyasını açın sunucunuzda kullandığınız php.ini yolu farklı ise onu açmalısınız

en son olarak

zend_extension = /usr/local/ioncube/ioncube_loader_lin_5.2.so kodunu en altta bir yere kopyalayabilirsiniz. Eğer sunucunuzda zend yüklü ise bunu zend üstünde olucak şekilde kopyalamanız gerekir. Buradaki 5.2 yerine php versiyonunuzu yazmanız gerekir. Örneğin php versiyonunuz 4.4.7 ise buraya 4.4 yazmanız gerekli.Son olarak dosyayı kaydedip çıkabilirsiniz.

php -v diyerek hata verip vermediğini kontrol edebilirsiniz.