Bazı botlar varki kod belasının ana kaynağı. htaccess dosyalarına kadar kendi kodlarını işlemekte. sizin bence yanıldığınız nokta bu olayla ilgili sunucuda ki diğer sitelerin o listede olmuyor olma ihtimali. Siz birinde var diğerlerinde yok diyerek direkt olarak sunucu güvenilirmiş demişsiniz. Bence yanlış bir düşünce. 100 siteden birine bile böyle birşey olabiliyorsa ilk bakılacak yer o sunucu sistemidir.

ayrıca bilgisayar virüsleri ftp ye bağlanıp dosyalara kod ekleyecekler komedi gibi. bence konyashell arkadaşın dediklerine uyun.ama bir öneride benden ftp'ye programla bağlanıyorsanız en azından bilindik programlar kullanın.birçok programın cracklemesinin nasıl yapıldığı kimse tarafından bilinmemektedir. kapersky evet yaygın olabilir ancak %100 hiç bir sistemi korumaz. internet security olan bir güvenlik yazılımı kullanın. kapersky şart değil. ancak asıl güvenliğin olması gereken yer kişisel bilgisayarınız değil sitenin vps kaydı olan sunucudur.

güvenilir birine temiz dosyaları tekrar attırın yada güvenilir bir yerden siz atın.ama aynı şeyler devam ettikçe kaynağıda belli olacaktır