iki yöntem var:

1- single.php'yi açıp,

<?php get_header(); ?>

kodunu silip, yerine header.php'deki kodları yapıştırırsınız. bu sayede sayfa header'ı, index ve arşivlerden farklı olur. meta tagları da dediğiniz gibi ayarlarsınız.

2- header.php'yi açıp,

<?php if ( is_home() ) { ?> ana sayfa başlığı <?php } ?>
<?php if ( is_single() ) { ?> sayfa başlığı <?php } ?>

şeklinde eklersiniz. bu sayede, eğer anasayfaysa şu kod, iç sayfaysa şu kod gelsin dersiniz.