Uzakmasaüstü erişiminizin olduğunu varsayarak aşağıdakileri uygulayabilirsiniz.

c:\inetpup\vhosts klasörüne gidin. daha sonra müşterinizin alan adının özelliklerinden IUSR_ftpkullanıcıadı ve ftpkullanıcıadı isimli kullanıcıların yetkilerini alın. httpdocs dizininde yetkiler kalacak. kullanıcıya plesk verirken web ve ftp kullanıcıları sayısını 0 yapmayı unutmayın.

Sunucu linux ise chown -f root:root /var/www/vhosts/musterialanadi && /var/www/vhosts/musterialanadi/httpdocs komutunu çalıştırın. Linux ise işiniz biraz daha kolay olur.

Daha etkili çözüm ise sitenin kodları şifreleyip vermek.

Bu yazdıklarımı denemedim ama mantıksal olarak işe yaraması gerekir.