Böyle durumlarda HTML ol "tag"ını kullanabilirsiniz. Sanırım aşağıdaki kod işinizi görür:
<?php
include ("db.php");
$result = @mysql_query("SELECT indirilme , isim , id FROM icerik ORDER BY indirilme DESC");

echo '
  <div class='top_row'>
   <p>SIRALAMA</p>
   <ol>';
while(list($indirilme, $isim, $id) = @mysql_fetch_row($result))
{
echo"

  <li><a href='indir.php?id=$id' title='$isim'><b>$isim</b></a>
  <br>
  <font color='red'> $indirilme </font><font color='#cccccc'> Kere İndirilmiş</font></li>";
}
echo '
</ol>
</div>';
?>
[konudışı]Kod yazma düzeni edinmenizi öneririm. İnsan nasıl alışırsa öyle gider... Siz doğrusuna alışın. xHTML ve düzenli kod yapısı kullanın.[/konudışı]