Elinde 3.x yedeğin varsa onu yükliceksin database olarak ve dosya olarak da tabi aynı sürümün dosyaları olacak.

vb 4.x upgrade yaptım demişsin, fazladan tablolar var birsürü, 4.x den sonra 3.x e upgrade olmaz. Sen 3.x yedeğini geri yükle.