videoları neyle çevirdiniz bilmiyorum ancak meta bilgilerinde "duration:" yok bu yüzden player süresini göstermiyor.

http://www.hasangul.com/flvtest/1.html bu flv dosyanız, metalarını görebilirsiniz

http://www.hasangul.com/flvtest/2.html bu da olması gereken yani içinde duration bulunan.

ffmpeg yerine mencoder ile çevirin videolarınızı. scriptin conversion dosyasını koyarsanız sizin için düzenleyebilirim. (mencoder versiyonunuzu da söylemeniz lazım)