.htaccess ile uğraşmana gerek yok bence. include("/deneme/dosya.php"); olarak yapabilirsin. Ama illaki .htaccess ile yapacağım dersen biraz araştırma yapman lazım.
Böyle yapınca da include ettiğim doyalar çekilemiyor. Hata veriyor. Ben wordpress ten biliyorum, wordpress bu işi yaptı ama nasıl yaptı anlamadım. Normalde wordpress /deneme/ klasörünün içinde kurulu ama
www.siteadi.com/deneme yazmak yerine direkt
www.siteadi.com yazinca sayfa yükleniyordu. Üstelik klasör görünmüyor.