Eğer ilerde çok kaynak tüketebilecek bir işlem yapacaksanız subdomain kullanmanız şarttır. Subfolder i başka sunucu üzerinden çalıştıramazsınız ama subdomaini çalıştırabilirsiniz. Seo açısından faydası konusunda yorum yapmayacağım o konuda çokta deneyimli sayılmam. 1 aylık konuyu hortlatıyorum ama yinede görüş belirtmeye değer