bir den fazla tabloyu union ile birleştirebilirsiniz üstad

SELECT sid, title FROM ".$prefix."_stories WHERE title LIKE '%$aranacak%' union all SELECT id, isim FROM ".$prefix."_isimler WHERE isim LIKE '%$aranacak%'

select te verdiginiz alan sayilarinin iki sorgudada eşit olmasi gerekir. Ayni sira ile sanki tek tablo imiş gibi gelir yani