Aynı sorun geçen gün benimde başıma geldi. phpmyadmin'den gzip ile aldığım yedeği yüklerken, 4 tablodan başka yüklemiyordu. Sonra phpmyadmin'den gzip değilde normal sql olarak aldım yedeği. Böyle yükledim sorun kalmadı. İstersen farklı formatta yedek alıp yüklemeyi bir dene.