sitenizde kullandığınız sisteme göre virüsün bulaştığı alanlar farklı olabilir hocam, mesela wordpress kullanıyorsanız, index.php bulaşmaz ama temanın bulunduğu index.php virüs bulaşır, siz tekara sitenizi ziyret ettiğinizde bilgisayarı yine tetikler sil baştan yine devam eder bu illet.
işin ilginci iframenin bulaştığı domain reseller ana domain.oradada sadece boş bir index var.wp sitelerime geçmiyor ama ana domaine musallat oluyor.