Yapman gereken en önemli şey FTP şifresini değiştirmektir. Değiştirdiğin halde yine sorun oluyorsa, nedeni ya şifreyi değiştirdiğin bilgisayarda virüs silinmemiş ve değişen şifreyi tekrar alıyor yada ftp içerisine dosya atmış işleri ordan yapıyor.

İkinci ihtimal varsa şöyle çözebilirsin;
Ftp ile dizinine bağlandıktan sonra dizin içindeki dosyaları yenilenme tarihine göre sıralat, en son değiştirilen dosya en üste gelsin. Böylelikle en son değişen dosyaları görmüş olursun. Senin değiştirmediğin yeni dosyaları yenileriyle (Yedek dosyayı at, yada indirip virüs içeren kısmını sil) değiştir. Bazen dizin içindeki dosyaların ismine benzer yeni bir dosya oluyor (Bu dosya adresini bildiği için çalıştırıp dosyalara tekrar virüslü kodları ekliyor) onu direkt olarak sil.