ben de zaman zaman karşılaşıyordum fakat genellikle ftp güncellemelerinde oluyor eğer ftp ye baglandığınız programı (ör:filezilla, flashfxp) açcınca direk güncelleme çıkıyor ve sizde onu güncelliyorsanız o zaman o programdan sitenize iframe virüsü bulaşıyor daha önce ben hep güncellerdim ama bunu öğrendiğimde hiç güncellemez oldum ve Allah nazardan korusun 2-3 aydır iframe virüsleri ile uğraşmıyorum. google aratırsanız dediğimin daha ayrıntılı bilgisine ulaşabilirsiniz.