Daha önce bir fikrim var demiştim ama bir türlü adsense kullanan bir siteye denk gelemedim.
Ben düşüncemi söyleyeyim.

Javascript ile flash aralarında veri alışverişinde bulunabilir.
Normalde sadece birbirlerinin fonksiyonlarını çalıştırabilirler, bu sayede de veri alışverişi olabilir.
Adsense kodları bir div,hücre veya bunun gibi bir tag içerisine konulur.Önemli olan bu tagın bir "id" si olması.Sayfa yüklendikten sonra java script çalışarak bu kodları alır ve içerisinden reklam metnini ve linkini çıkarır.(Bkz. Çıkarma işlemi)
Çıkardığı verileri flash içerisine gönderir.Flash tarafındada alınan bu datalar istenildiği gibi yerleştirilir.

Bu yöntem eğerr site tamamen flash ise google kurallarına pek uymaz.
Çünkü anlattığım yöntemde reklamlar hem sayfada hemde flash içerisinde görünüyor.
Tamamen flash olan bir sitede reklamların gizlenmesi gerekir, bunada google biraz kızabilir.

Çıkarma işlemi

Bu işlem her dilde olan string işlemleri ile yapılır.
Örneğin <a href="xyz.com">link</a> satırından linki ve metni çıkarmak için.
href=" harleri aranır. Bu harfler bulundukları karakter sırasından ikinci tırnak işaretine kadar olan yer alınır.
Metin için yine aynı işlem uygulanır.
> işaretinden başlayarak < işaretine kadar olan kısım alınır.