ftp de bir klasör aç veya bilgisayarından gönder fark etmez, sonra normal şekilde kurulumu yapabilirsin. ana dizine kurmak ile klasöre kurmak arasında bir fark yok.
yeni, kurulum değil de değiştirme yapmak istiyorsan da dosyaları yeni açtığın klasöre kopyalarsın veya taşırsın. tabi bir de panelden yeni domaini ayarlamak gerekiyor.( duruma göre sonra veya ilk yapabilirsin bunu)
yönlendirme ile ilgili forumda konular mevcut.