shared bir hosttan hizmet alıyorsan zaten sitenin ana klasorunun bulunduğu klasorde alt domainler klasor halinde bulunur.yani xxx olsun alt domain adı.

include "xxx/beniinclude.php"; yapabilirsin
yada alttan ana ayar dosyasını include ediceksen
include "../anaayar.php"; şeklinde yapabilirsin.