java dan pek anlamam ama sanırım problem fonksiyonda ki
mywindow parametresi ile ilgili mywindow yazısını
_blank yapıp dener misiniz bir.
Alıntı
<script language="javascript">
function haritapopup()
{
mywindow = window.open ("haritadagoster.php?id=<?=$id;?>", "_blank","location=0,status=1,scrollbars=0,width=300,heig ht=400");
mywindow.moveTo(screen.width/2-506,screen.height/2-339);
}