Javascript bilgim pek yok ama " " arasına php başlatıp bitirdiğin için olabilir diye tahmin ettim.Böyle denermisin.

	<?php
	include("../../../baglanti.php");
	$resimSql = "SELECT * FROM resimler";
	$resimSonuc = mysql_query($resimSql);
	while($resimSatir = mysql_fetch_assoc($resimSonuc))
	{
		$resim = $resimSatir["resimAdi"];
	?>
	new Array(<?=$resim; ?>, "650", "488", "Resim için açıklama"),
	<?php } ?>