konuyu hortlatıcam belki ama bilgi almak isteyen başkaları olursa faydası olur belki. bu sorun çok fazla mysql kullanımından kaynaklanıyor. sunucudaki tek yoğun site sizinkisiyse birkaç dakika siteye erişilememesi için mysql ayarlarını değiştirip bağlanmamalarını sağlarsanız phpmyadmin hızlanacaktır.