Birkaç yönden var aslında.

iframe ile açtığın sayfada olan bazı kodlar senin sayfan içinde çalışabilir.
Mesela yönlendirme varsa hit kaybedebilirsin ama pek fark yapmaz.Bu müzik kodu reklam kodu vs de olabilir.

İç sayfadaki linkler blank mı parent mi olduğuda önemli.Bu küçük sayfadaki bir linke tıklandığında sayfa ya yeni pencerede açılır ya bu iframe içinde açılır yada senin sitenin olduğu sayfadan direk açılır.(ve bunları iframe içindeki site belirler.)

Daha sonra senin safanda olduğu için alt sayfada sitene girildiği zaman yükleneceği için sayfanın açılma süresini ve performansını etkileyecektir.

Belki Google sana alıntı yapıyormuşsun gibi bi muamele yapabilir içerik aynı.(sanmam)

Evet yazdım biride benim sorumu cevaplasa keşke.