yakalanmayan kod için popup diye aratma, google da popup div diye arat, hemen bulursun.
bir saatte bir çalışan popup açmak kolay, javascript timer konusu olmuştu burda, oraya bişeyler yazmıştım, o konudan araştırırsan hemen çözersin olayı, ama burda özetleyim.

jquery ile yapabilirsin. jquery timer plugini indir (bi kaç tane var, birini seç ama callback fonksiyonu olsunki daha rahat yap).
süre bittikten sonra callback ile çağırdığın fonksiyonun işlevi, divin visibility (veya sadece hide, show ile de yapabilirsin, css attribute ile de olur) değerini değiştirmek olacak, çok zor değil yani.