<?php
$dosya = "dosya.txt"; //okunacak dosya
$oku = file($dosya); //okuma işlemi
$len = count($oku); //toplam satir
for ($i = 0; $i < $len; $i++) //döngüyü baslat

{
    $okunan = trim($oku[$i]); //satiri al ve sagindaki solundaki bosluklari temizle
    if (!empty($okunan)) //eger satir boş degil se

    {
        $yazilacak .= $okunan . ","; //yazilacaklar listesine ekle
    }
}
$yenidosya = 'yenidosya.txt'; //yazilacak dosya
$yazilacak = substr($yazilacak, 0, -1); //en sağda fazladan kalan virgülü sil
$fp = fopen($yenidosya, 'w'); //yazilacak dosyayi acalim
fwrite($fp, $yazilacak); //verileri yazdir
fclose($fp); //dosyayi geri kapat
?>