footer.html dosyasına JavaScript ekleyemezsiniz,
theme.php dosyasını açıp aşagıdaki satırı bulun;

function themefooter() {

aşagıdaki satırın bir üstüne aşagıdaki kodları ekleyin;

$toplist="<script type=\"text/javascript\" src=\"http://zirve100.com/CounterV4.js\"></script>
<script type=\"text/javascript\">Zirve100_Counter_Main(230108, 1);</script>
<!-- Zirve100 kodu sonu -->
<!-- Optional backlink start -->
<span style=\"font-size:11px; font-family:Arial;\"><br />Zirve100 <a href=\"http://www.zirve100.com/\">Site ekle</a></span>";

ve sonrada footer.html dosyasını açın yukarıdaki kodu nerede göstermek istiyorsanız sadece aşagıdaki kodu yazmanız yeterli olacaktır..

$toplist

.