Kod içerisindeki
the_permalink()
kodunu
the_permalink();
olarak değiştirir misiniz? Başka bir hata yok gibi görünüyor. Olmazsa temanın orijinal search.php dosyasını atıp, deneyin ya da varsayılan temanın search.php dosyası ile kendinizinkini karşılaştırın.