WordPress'te eğer ana dizinde bir wp-config.php dosyası varsa, wordpress onu kullanmaya çalışır. Eğer birden fazla kurulum yapılacaksa bunların alt klasörlerde yapılması uygun olacaktır. Yani
root
wp1
wp2
şeklinde.
Eğer root'ta bir wp-config.php varsa wordpress diğerlerini görmenize izin vermez. Bunun için ya ana dizindeki WP'yi bir alt dizine taşıyacaksınız ya da wp'nin dosyalarıyla oynayacaksınız.
wp-admin\setup-config.php dosyasında 42, 46. vs. wp-config'in varlığı kontrol ediliyor, wp-load.php dosyasında ise 24 ve 29. satırlarda wp-config dosyasının varlığı kontrol ediliyor, önce root'ta var mı ona bakılıyor ve varsa eğer yükleniyor.
Anlayacağın, problemin kaynağı veritabanı ya da sunucu değil, wp'nin yapısından kaynaklanıyor.
Benim tavsiyem ana dizindeki wp'yi bir alt dizine taşıman.