sorunun direkt admin ile ilgisi yok. php modül olarak kurulmuşsa yani cgi olarak kurulmadıysa ve sistemde suphp kurulu degilse otomatik olarak apache nin conf dosyasında tanımlı olan kullanıcısını kullanır.
oluşturduğunuz dosyaların yetkilerini php nin chmod fonksiyonu ile
PHP: chmod - Manual
yada sahipligini (sahipliğini değiştirdiginiz durumda apache nin kullanıcısınında erişebilecegi şekilde olması gerek yoksa kendi oluşturduğunuz dosyalara erişememez duruma düşersiniz) değiştirerekte işlem yapabilirsiniz.
PHP: chgrp - Manual PHP: chown - Manual
bunların içinde kendim şahsen chmod yaklaşımını kullanıyorum.