konu eskimiş ama cakatoj87 gibi bu problemle karşılaşması muhtemel kişiler için yazıyorum.
Dosyalarınız FTP dizininde mesela httpdocs klasörünün içindeyse site haritanızı şöyle ekleyeceksiniz:
"www.siteadı.com/httpdocs/sitemap.xml"
yanlış bilgi verme httpdocs zaten root dizin. eğer siteadı.com/simapadı.uzantısı şeklinde çağırdığında cevap alıyorsan sitemapte sorun yoktur