Database configurasyon dosyasındaki (my.cnf) parametreler değişmiştir.
bu sebeple performans kaybı olmuş olabilir.
MySQL i çok iyi bilmem ama emin olmamakla beraber versionda storage engine ler değiştiyse, tabloları dump export edip tekrar batch ile yükleyin belki çözülmüş olur.