hiç bir sorun yaşamazsın. Zaten kuracağın sürüm senin yüklü sürüm ile arasında ne kadar versiyon var ise hepsini update yaparak en son sürüme ulaşıyor.

Tek sorun senin 3.6 da çalışan bazı eklentilerin 3.8.1 olan son sürümde çalışmayabilir onun için bir yedek al tabi update yapmadan önce.