if($uid == $uye_id) { 
$duzenle="[ <a href='yorum_duzenle.php?makale_id=$dok[makale_id]'>Duzenle</a> ]"; 
}
elseif($uid !== $uye_id) { 
$duzenle=""; 
}

elseif kullanmamışız sanırım o yüzden oldu yani biz == eşitse düzenle linkini çıkart demişiz ama eşit değilse yani diğer şartlarda düzenle linkini gösterme dememişiz sanırım ondan kaynaklandı yukarıdaki ile if satırını değiştirirsen sorun kalkacaktır