eğer elinizdeki script büyük ve kapsamlı birşeyse bu işe hiç kalkışmayın .. çünkü çok köklü değişiklikler gerektiriyor bunu söliyim eğer hala yapmak isterseniz bilgi verebilirm çünkü anlatımıda uzun olacak o yüzden

ama kısaca

<IFRAME name="frame_ismi" src="frameadresi.html" width="600" height="115" scrolling="no" frameborder="0" marginwidth="0" marginheight="0"></IFRAME>

burdaki blood yazan yerdeki url yee göre sayfadaki iframe değişecektir. bu düzenlemeye göre sayfalardaki tüm linkleri değişmesi gerekir. linkler " <a href=asdasd.html> asd </a> " olarak değil " <a href=# onClick=urldeis('asdsad.html') > asdasd </a> " olarak çalışması gerekir.

urldeis fonksiyonuna çok basit bir örnek vermk gerekirse
<script>
function urldeis(url){
var beko = document.getElementById('frame_ismi');
beko.src = url;
}
</script>

böle çalışacaktır bunlar en basit örneklerdir direk kopyalarsanız çalışmaz
dediğim gibi eğer script kapsamlı ise hiç bulaşmamanız çünkü urlleri değiştirmek adamı gerçekten sinir etmekte(bende snir ediyor )