Hocam söylediğin scriptle hiçbir bilgim yok ancak başka bir arkadaş yazmadığı için bilmesemde belki tutar düşüncesiyle bir iki şey söylemek istiyorum.

Öncelikle script'te " index.html " , "header.html" adlarında dosyalar varsa ki vardır..bunları bulabilirsen bir tanesinde en üstte şöyle birşey vardır..

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=XXXXXXXX">
Bunu bulduktan sonra orada " charset " kısmı var onu şununla değiştirebilirsin

charset=windows-1254

Bu işlem sitede ki Türkçe karakter sorununu çözecektir.(Doğru yapıldığında)