Bildiğim kadarı ile bu bir virüs olarak geçiyor. İndex'in altına bak ve iframe içerisinde kod varsa sil. Eğer bu yöntem başarılı olursa;

Ftp'ye tekrar herhangi bir dosya at ve sonra siteye tekrar gir. Eğer gene virüs uyarısı alırsan virüs bilgisayarında demektir. İyi bir antivirüs taraması yap. Olmadı format