Linux ve tabikide Mysql ne kadar uzun süreli çalışırsa o kadar randıman alırsınız, bence linux sunuculara kolay kolay reboot denemeyiniz.

Co-location yapmıyorsanız tabikide o senenin teknolojilerini takip etmelisiniz ve sistemi yenilemesiniz. ve mutlaka yedek bir disk olsun sunucunuzda.