her subdomain ayrı bir domaindir.
her subdomain için ayrı ayrı backlink alınması ve ayrı seo yapılması lazımdır.
alt klasör içinde siteye genel yaptığın seo etkili olur.
Çünkü google her subdomaini ayrı bir domain olarak görür.
Hatta http://siteismi ve http://www.siteismi bile farklı domainler olarak görülür.