Yaklaşık 1.5 yıl önce belirli zamanlarda aynı şey başıma gelmişti Cuteftp ve FlashFXP programları index dosyalarına iframe kod bırakıyordu daha sonra filezilla kullanmaya başladım(1,5 yıldır) bu olaydan kurtuldum

Not: FTP ye İE tarayıcısıyla ftp.siteadı.com şeklindede girerek sorun ortadan kalkmıştı